Bodrum-borgen (St. Peters borg) blev opført af Johanniterordenen, en korsfarerorden, i 1402 — delvis med sten fra det allerede sammenstyrtede mausoleum i Halikarnassos, et af oldtidens syv vidundere. Borgen ligger på en lille halvø, der deler Bodrums to havnebugter, og kan ses fra stort set overalt i byen.
I dag huser borgen Bodrum Museum of Underwater Archaeology, med fund fra flere skibsvrag opdaget langs Tyrkiets ægæiske kyst, deriblandt et af verdens ældste kendte skibsvrag fra bronzealderen. Museets forskellige tårne, hver opkaldt efter de europæiske nationer der bidrog til borgens opførelse, rummer separate udstillinger.